При HPLC анализ размерът на частиците на опаковката на хроматографската колона е малък и е лесно да се блокира от примесните частици. Следователно, пробите и разтворителите трябва да бъдат филтрирани предварително, за да се отстранят замърсителите на частици и да се защитят инструмента. Йонната хроматография, която обикновено се използва при анализ на околната среда, също изисква да не се въвеждат неорганични замърсители в проточенията на пробата. Филтрите за спринцовка могат да се използват при HPLC анализ и IC анализ за филтриране на проби разтвори, което е важна стъпка в процеса на предварителна обработка на пробата.