За някои приложения полипропилен HPLC флаконите не са подходящи поради техния състав и техните химични свойства. Сред тях са анализ на тежки метали, анализ на вода и протеини, атомна абсорбция, капилярна електрофореза (CE) и йонна хроматография (IC). За всички тези случаи са налични полипропиленови флакони с висока чистота с 0,3 ml, 0,7 ml и 1,5 ml в прозрачен и кехлибар.