Gall y dewis o ffiolau autosampler ymddangos yn llawer llai pwysig o gymharu â'r offerynnau cromatograffeg arwyddocâd y mae llawer o labordai yn eu defnyddio. Fodd bynnag, mae'n ddigon posib y bydd y dewisiadau anghywir o ffiolau HPLC neu GC, capiau, septas a mewnosodiadau yn arwain at gynhyrchiant arbrofi is ac atgynyrchioldeb neu hyd yn oed ddifrod mecanyddol i'r autosampler.