I HPLC -analyse er partikelstørrelsen af den kromatografiske søjlepakning lille, og det er let at blive blokeret af urenhedspartikler. Derfor skal prøver og opløsningsmidler filtreres på forhånd for at fjerne partikelformige forurenende stoffer og beskytte instrumentet. Ionkromatografi, der ofte bruges i miljøanalyse, kræver også, at der ikke indføres nogen uorganiske forurenende stoffer i prøveforbehandling. Sprøjtefiltre kan bruges i HPLC -analyse og IC -analyse til at filtrere prøveopløsninger, hvilket er et vigtigt trin i prøveforbehandlingsprocessen.