Valget af autosampler hætteglas kan virke meget mindre vigtigt sammenlignet med betydningen af kromatografinstrumenter, som mange laboratorier bruger. Imidlertid kan de forkerte valg af HPLC- eller GC -hætteglas, hætter, septas og indsatser godt føre til lavere eksperimentproduktivitet og reproducerbarhed eller endda mekanisk skade på autosampleren.