HPLC -analyysissä kromatografisen pylvään pakkauksen hiukkaskoko on pieni ja epäpuhtauspartikkeleiden estäminen on helppo. Siksi näytteet ja liuottimet on suodatettava etukäteen hiukkasten epäpuhtauksien poistamiseksi ja instrumentin suojaamiseksi. Ionikromatografia, jota yleisesti käytetään ympäristöanalyysissä, edellyttää myös, että epäorgaanisia epäpuhtauksia ei oteta käyttöön näytteen esikäsittelyssä. Ruiskunsuodattimia voidaan käyttää HPLC -analyysissä ja IC -analyysissä näytteen liuosten suodattamiseksi, mikä on tärkeä vaihe näytteen esikäsittelyprosessissa.
