La chromatographie septas peut être pré-fente. Un septum pré-fendu est un choix idéal dans les applications nécessitant 20% ou plus de l'injection d'échantillon à chaque fois du flacon afin que l'aspiration soit évitée. La fente permet au gaz ambiant d'égaliser le gaz dans le flacon afin qu'un vide ne soit pas créé dans le flacon à partir du joint serré autour de l'aiguille. Si le carotage ou le colmatage à partir d'une flèche d'aiguille ou d'aiguille étroite à partir de septa très durables est une préoccupation, le choix d'un septum pré-fendu est un meilleur choix.
Un silicone PTFE \ / avec un septum fendu permet une pénétration plus facile de l'aiguille ainsi que de libérer le vide qui se forme lorsqu'un grand volume d'échantillon est retiré d'un flacon. Ce septum fournit des caractéristiques chromatographiques similaires à celles d'un septum sans fente, sauf que la capacité de résister à l'exposition à des solvants agressives est légèrement diminuée. Les septa pré-fendus sont fortement recommandés pour améliorer la reproductibilité de l'injection à l'injection avec des échantillonneurs automobiles qui se retiraient plus de 50 µl d'échantillon d'un flacon de 2 ml, en raison d'une éventuelle cavitation (vide).