એચપીએલસી વિશ્લેષણમાં, ક્રોમેટોગ્રાફિક ક column લમ પેકિંગનું કણ કદ નાનું છે અને અશુદ્ધિઓ કણો દ્વારા અવરોધિત કરવું સરળ છે. તેથી, કણોના દૂષણોને દૂર કરવા અને સાધનને સુરક્ષિત રાખવા માટે નમૂનાઓ અને દ્રાવકોને અગાઉથી ફિલ્ટર કરવાની જરૂર છે. આયન ક્રોમેટોગ્રાફી, જેનો ઉપયોગ સામાન્ય રીતે પર્યાવરણીય વિશ્લેષણમાં થાય છે, તે પણ જરૂરી છે કે નમૂના પ્રીટ્રિએટમેન્ટમાં કોઈ અકાર્બનિક પ્રદૂષકો રજૂ કરવામાં ન આવે. નમૂના ઉકેલોને ફિલ્ટર કરવા માટે એચપીએલસી વિશ્લેષણ અને આઇસી વિશ્લેષણમાં સિરીંજ ફિલ્ટર્સનો ઉપયોગ કરી શકાય છે, જે નમૂના પ્રીટ્રિએટમેન્ટ પ્રક્રિયામાં એક મહત્વપૂર્ણ પગલું છે.