Izbor autosamplernih bočica može se činiti mnogo manje važnim u usporedbi s instrumentima za kromatografiju značajne koje mnogi laboratoriji koriste. Međutim, pogrešni izbori HPLC ili GC bočice, kape, septes i umetke mogu dovesti do niže produktivnosti eksperimenta i obnovljivosti ili čak mehaničkog oštećenja autosamplera.