A HPLC elemzés során a kromatográfiás oszlopcsomagolás részecskemérete kicsi, és a szennyeződés részecskékkel könnyen blokkolható. Ezért a mintákat és az oldószereket előre szűrni kell a részecskék szennyeződéseinek eltávolítása és a műszer védelme érdekében. Az ionkromatográfia, amelyet általában a környezeti elemzés során használnak, szintén megköveteli, hogy a minta előkezelésében nem vezetnek szervetlen szennyező anyagokat. A fecskendőszűrők használhatók a HPLC elemzésben és az IC elemzésben a mintaoldatok szűrésére, ami fontos lépés a minta előkezelési folyamatában.
