Az autosampler -fiolák megválasztása sokkal kevésbé tűnik, összehasonlítva a sok laboratórium által használt szignifikancia kromatográfiás eszközökkel. A HPLC vagy GC üvegek, sapkák, septák és betétek helytelen választása azonban alacsonyabb kísérleti termelékenységet és reprodukálhatóságot, vagy akár az autoszintos mintavevő mechanikai károsodásához vezethet.