ზოგიერთი პროგრამისთვის პოლიპროპილენის HPLC ფლაკონები არ არის შესაფერისი მათი შემადგენლობისა და მათი ქიმიური თვისებების გამო. მათ შორისაა მძიმე ლითონის ანალიზი, წყლისა და ცილების ანალიზი, ატომური შეწოვა, კაპილარული ელექტროფორეზი (CE) და იონის ქრომატოგრაფია (IC). ყველა ამ შემთხვევისთვის მაღალი სიწმინდის პოლიპროპილენის ფლაკონები 0.3 მლ, 0.7 მლ და 1.5 მლ გამჭვირვალე და ქარვაშია შესაძლებელი.