Изборот на ампули за автосамплери може да изгледа многу помалку важен во споредба со значењето на инструментите за хроматографија што ги користат многу лаборатории. Како и да е, погрешните избори на HPLC или GC ампули, капачиња, септи и инсерти може да доведат до помала продуктивност на експериментот и репродуктивност или дури и механичко оштетување на автосамплерот.
