Voor sommige toepassingen zijn polypropyleen HPLC -flessen niet geschikt vanwege hun samenstelling en hun chemische eigenschappen. Onder deze zijn zware metaalanalyse, water- en eiwitanalyse, atoomabsorptie, capillaire elektroforese (CE) en ionchromatografie (IC). Voor al deze gevallen zijn hoge zuiverheid polypropyleenflacons met 0,3 ml, 0,7 ml en 1,5 ml transparant en barnsteen beschikbaar.
