I HPLC -analyse er partikkelstørrelsen til den kromatografiske kolonnepakningen liten, og det er lett å bli blokkert av urenhetspartikler. Derfor må prøver og løsningsmidler filtreres på forhånd for å fjerne partikkelforurensninger og beskytte instrumentet. Ionekromatografi, som ofte brukes i miljøanalyse, krever også at ingen uorganiske miljøgifter blir introdusert i prøveforbehandling. Sprøytefiltre kan brukes i HPLC -analyse og IC -analyse for å filtrere prøveløsninger, som er et viktig trinn i prøvebehandlingsprosessen.