ਕਈ ਪ੍ਰਯੋਗਸ਼ਾਲਾਵਾਂ ਦੁਆਰਾ ਵਰਤੇ ਜਾਣ ਵਾਲੇ ਮਹੱਤਵ ਕ੍ਰੋਮੈਟੋਗ੍ਰਾਫੀ ਯੰਤਰਾਂ ਦੇ ਮੁਕਾਬਲੇ ਆਟੋਸੈਂਪਲਰ ਸ਼ੀਸ਼ੀਆਂ ਦੀ ਚੋਣ ਬਹੁਤ ਘੱਟ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਲੱਗ ਸਕਦੀ ਹੈ। ਹਾਲਾਂਕਿ, HPLC ਜਾਂ GC ਸ਼ੀਸ਼ੀਆਂ, ਕੈਪਸ, ਸੇਪਟਾਸ ਅਤੇ ਇਨਸਰਟਸ ਦੀਆਂ ਗਲਤ ਚੋਣਾਂ ਘੱਟ ਪ੍ਰਯੋਗ ਉਤਪਾਦਕਤਾ ਅਤੇ ਪ੍ਰਜਨਨਯੋਗਤਾ ਜਾਂ ਆਟੋਸੈਮਪਲਰ ਨੂੰ ਮਕੈਨੀਕਲ ਨੁਕਸਾਨ ਦਾ ਕਾਰਨ ਬਣ ਸਕਦੀਆਂ ਹਨ।