Wybór fiolek autosamplera może wydawać się znacznie mniej ważny w porównaniu z instrumentami chromatografii istotności wielu laboratoriów. Jednak niewłaściwe wybory fiolek HPLC lub GC, CAPS, przegrody i wstawki mogą prowadzić do niższej wydajności eksperymentalności i odtwarzalności, a nawet mechanicznego uszkodzenia autosamplera.