A escolha dos frascos de amostradores automáticos pode parecer muito menos importante em comparação com os instrumentos de cromatografia de significância que muitos laboratórios usam. No entanto, as escolhas erradas dos frascos de HPLC ou GC, CAPs, SEPAs e inserções podem levar a menor produtividade e reprodutibilidade do experimento ou mesmo danos mecânicos ao amostrador automático.