Pentru unele aplicații, flacoanele de polipropilenă HPLC nu sunt potrivite datorită compoziției lor și proprietăților lor chimice. Printre acestea se numără analiza metalelor grele, analiza apei și a proteinelor, absorbția atomică, electroforeza capilară (CE) și cromatografia ionică (IC). Pentru toate aceste cazuri, sunt disponibile flacoane de polipropilenă de înaltă puritate cu 0,3 ml, 0,7 ml și 1,5 ml în transparent și chihlimbar.