Për disa aplikacione, shishkat e polipropilenit HPLC nuk janë të përshtatshme për shkak të përbërjes së tyre dhe vetive të tyre kimike. Ndër këto janë analiza e metaleve të rënda, analiza e ujit dhe proteinave, thithja atomike, elektroforeza kapilare (CE) dhe kromatografia jonike (IC). Për të gjitha këto raste shishkat polipropilen me pastërti të lartë me 0.3 ml, 0.7 ml dhe 1.5 ml në transparente dhe qelibar janë në dispozicion.
