Chaguo la viini vya autosampler inaweza kuonekana kuwa muhimu sana ikilinganishwa na umuhimu wa vyombo vya chromatografia maabara nyingi hutumia. Walakini, uchaguzi mbaya wa HPLC au viini vya GC, kofia, septas na kuingiza zinaweza kusababisha uzalishaji mdogo wa majaribio na kuzaliana au hata uharibifu wa mitambo kwa autosampler.