Bazı uygulamalar için polipropilen HPLC şişeleri bileşimleri ve kimyasal özellikleri nedeniyle uygun değildir. Bunlar arasında ağır metal analizi, su ve protein analizi, atomik absorpsiyon, kılcal elektroforez (CE) ve iyon kromatografisi (IC) bulunmaktadır. Tüm bu durumlar için, şeffaf ve kehribarda 0.3 mL, 0.7 mL ve 1.5 ml'lik yüksek saflıklı polipropilen şişeler mevcuttur.