Вибір флаконів автозамплерів може здатися набагато менш важливим порівняно з інструментами для хроматографії значущості, які використовують багато лабораторій. Однак неправильний вибір флаконів ВЕРХ або GC, ковпачків, перегородки та вставки цілком може призвести до зниження продуктивності та відтворюваності експерименту або навіть механічного пошкодження автозамплера.