Sự lựa chọn của các lọ tự động mẫu có vẻ ít quan trọng hơn nhiều so với các công cụ sắc ký có ý nghĩa mà nhiều phòng thí nghiệm sử dụng. Tuy nhiên, các lựa chọn sai của lọ HPLC hoặc GC, mũ, vách ngăn và chèn cũng có thể dẫn đến năng suất và khả năng tái tạo thí nghiệm thấp hơn hoặc thậm chí thiệt hại cơ học cho bộ lấy mẫu.