Für einige Anwendungen sind Polypropylen -HPLC -Fläschchen aufgrund ihrer Zusammensetzung und ihrer chemischen Eigenschaften nicht geeignet. Unter diesen befinden sich Schwermetallanalyse, Wasser- und Proteinanalyse, Atomabsorption, Kapillarelektrophorese (CE) und Ionenchromatographie (IC). In all diesen Fällen sind hohe Reinheit Polypropylenfläschchen mit 0,3 ml, 0,7 ml und 1,5 ml transparent und Bernstein verfügbar.